華大重“智造”、貝瑞押注腫瘤業務,風云時代的NGS企業們都在干嘛?
諾禾致源:腫瘤用藥檢測取得突破,尋求多組學業務發展
諾禾致源最早從科研服務起家,2015年,諾禾致源以3.5億的國內科研服務收入超過華大基因的科研服務收入,成為業內最大的科研服務提供商。
2018年12月,諾禾致源發布首次公開發行股票并在創業板上市招股說明書。招股書顯示,諾禾致源擬發行4020萬股,在深交所創業板上市,保薦人為中信證券,報告期內研發費用占營業收入的比重分別為14.67%、6.66%、6.81%、7.01%,擁有專利22 項、軟件著作權149項。他們極有可能成為NGS領域第三家上市企業。
隨著NGS技術臨床化的趨勢越來越明顯,諾禾致源也早就開始通過生育業務和腫瘤業務布局臨床。目前,諾禾致源主要依托高通量測序技術,結合其他基因檢測方法,為科研機構、高校、醫療機構、藥業等企事業單位提供基因檢測和生物信息分析等研究服務。
近幾年,諾禾致源通過一面推進腫瘤產品的申報,一面繼續鞏固多組學服務能力,雙管齊下繼續保持行業領航優勢。
2017年3月,諾禾致源從Illumina引進了最新測序平臺NovaSeq。據透露,這是NovaSeq的全球首批產品。在2014年同樣作為全球首批用戶引進HiSeq X Ten后,諾禾致源已經成為全球最大測序服務中心,NovaSeq落地后,諾禾致源將實現每年 280,000 人全基因組測序的超高通量。
2017年7月,諾禾致源Digital PCR NG獲食藥監局批準上市,食藥監局明確該儀器適用于來源于人體的血漿游離DNA樣本中的T790M突變進行檢測,后續可與諾禾致源正在進行注冊申報的人EGFR基因T790M突變檢測試劑盒配合使用。該儀器也成為了國內首個獲食藥監局批準上市的數字PCR芯片閱讀儀。
2017年9月,諾禾致源宣布引進5套賽默飛Orbitrap系列最新發布超高分辨質譜儀Q Exactive? HF-X,強勢進軍蛋白質組學領域。該平臺顯著提升了蛋白檢測的靈敏度、定量重現性和樣本通量,更適用于復雜生物樣本的蛋白質組學的深度研究。借助賽默飛先進的高分辨質譜平臺,標志著諾禾致源的目光將從基因測序領域,轉向更為全面的多組學領域。
2019年7月,諾禾致源宣布與美國基因診斷公司Mission Bio在達成深度戰略合作,布局單細胞DNA測序領域。
Mission Bio于2012年成立于美國南加州硅谷,專注于高通量單細胞水平的分子診斷和基因組精準醫療。2017年這家公司率先推出了商業化的單細胞 DNA 分析平臺 TapestriTM。
相較于其它單細胞分析平臺,Mission Bio TapestriTM不單可以在上萬個細胞的高通量條件下,將檢測靈敏度提高至可檢測到癌癥中1%的稀有細胞,還可以監測到在癌癥治療期間突變的共同發生(mutation co-occurrence)。
借助MissionBio的單細胞DNA測序平臺,諾禾致源和MissionBio將在中國的精準醫療和個體化用藥領域加速助力臨床研究。
另外,為了在數據處理上滿足日益層長的測序需求,諾禾致源也在通過于數據服務和云服務公司合作,加速數據計算速度
2017年11月,諾禾致源與榮之聯簽訂戰略合作協議,雙方將在生物云、NGS 共同體和內部生產系統等方面達成全面合作,為全球基因測序市場提供更便捷、更有競爭力的服務產品。
2017年12月,“中國10萬人基因組計劃”啟動。作為國內領先的測序服務公司,諾禾致源也參與其中。
為了提高其數據計算速度,諾禾致源從幾年前就開始推進基因測序上云建設,并已將基因測序業務陸續遷移到阿里云。借助阿里云的計算和存儲能力,諾禾致源能在17分鐘內就加載完1萬個人類全基因組數據,僅用1.5小時就可完成單個基因測序pipeline,極大縮短了測序的時間。
不僅如此,得益于監管層面的突破和自身的積累,諾禾致源在腫瘤業務上也取得了重大突破。
2017年4月,諾禾致源“人EGFR、KRAS、BRAF、PIKCA、ALK、ROS1基因突變檢測試劑盒(半導體測序法)”進入CFDA創新醫療器械特別審批程序。除了諾禾以外,燃石醫學、艾德生物、世和基因、飛朔生物幾家公司也均有產品進入“綠色通道”。
2018年8月,諾禾致源“人EGFR、KARS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突變檢測試劑盒(半導體測序法)”獲得中國藥品監督管理總局的上市批準。該試劑盒能夠一次性測EGFR、KARS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1 六個基因的突變情況,指導吉非替尼、奧希替尼、克唑替尼等肺癌靶向藥物在臨床的使用。作為首批獲得批準上市的腫瘤NGS產品,該試劑盒的上市拉開了NGS技術在臨床規范化應用的序幕。
同年9月,諾禾致源“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突變檢測試劑盒(半導體測序法)”配套的分析軟件上市,這也是國內首個基于腫瘤NGS數據分析軟件的III類醫療器械注冊證。在人類疾病研究中,諾禾致源已具有超過 150 種疾病和腫瘤的分子機理研究經驗。
安諾優達:加碼三代測序
C輪后的安諾優達加大了在科研方面的投入,也引進了包括Oxford nanopore、Pacbio在內的一系列新平臺。
2017年12月,安諾優達宣布引進10臺PacBio三代測序儀,加碼國際領先基因組中心建設。次年4月,安諾優達正式與PacBio達成戰略合作計劃,雙方將就SMRT單分子測序技術在動植物基因組學基礎研究、醫學基礎研究和轉化醫學研究等領域的應用展開深度合作。
同時,雙方也將在重要農業種質資源基因庫構建方面開展深入合作,進一步推動基因科技在農業育種領域的應用。到了2019年8月,安諾優達PacBio三代測序儀平臺數量已經達到12臺。
PacBio Sequel平臺的引入,將進一步豐富ATCG數據庫的遺傳變異信息。通過這些戰略部署,安諾優達將在基因數據的生產、存儲和分析等方面進一步形成服務用戶的重要基礎。
同期引進的還有Oxford nanopore測序平臺。2018年12月,安諾優達宣布正式與Oxford Nanopore達成合作,引進Oxford Nanopore最高通量測序平臺PromethION。PromethION是Oxford Nanopore推出的最新款超高通量測序設備,它支持實時、長讀長、直接DNA和RNA測序工作流程。安諾優達希望能夠通過此舉增強自己大規模基因組學的服務能力,擴大基因組中心的國際影響力。
合作方面,除了與生命科學及農業的科研機構建立關系以外,安諾優達還在2018年8月與可瑞生物達成了戰略合作。
可瑞生物是由多位北大校友和海歸共同創立的生物技術公司,致力于抗腫瘤免疫治療技術的研發、基因編輯產品的開發和服務,以及遺傳疾病基因治療的探索。
此次戰略合作的目的是將安諾優達在高通量測序服務領域的優勢與可瑞生物在基因編輯技術領域的優勢相結合,就表觀基因組學測序技術、單細胞多組學測序技術和三維基因組學測序技術與基因編輯技術的整合應用展開深度合作。此次合作充分整合了雙方的優勢資源,促進雙方在科研服務及精準醫療領域互惠共贏。
醫學業務上,安諾優達在2017年11月引進了Illumina當時最新的測序平臺NovaSeq 6000,進一步擴大期在大數據、大樣本的測序分析服務能力(NovaSeq 6000適用于幾乎任何基因組、任何測序方法和規模的項目,也可用于科研服務項目)。
2018年9月,浙江安諾優達生物科技有限公司開業慶典在浙江義烏隆重舉行,標志著安諾優達南方中心正式投入運營。
據了解,南方中心目前已部署了包括二代測序儀NovaSeq 6000、三代測序儀Pacbio Sequel等在內的一批高性能的高通量測序平臺。再加上同年7月獲批成立的安諾優達生命科學研究源,南方中心將依托于北京總部在基因測序產業鏈上、中、下游掌握的核心資源優勢,打造涵蓋醫學檢驗中心、科技服務中心、基因健康中心、儀器試劑制造中心、生命科學研究院在內的基因科技生態系統。
醫學和科研服務是安諾優達發展的兩條路線,早年間,這家公司和貝瑞基因一樣選擇從NIPT到腫瘤過渡的發展路線。除了NIPT和腫瘤,安諾優達還一度發展了云業務、微生物檢測、表觀遺傳學業務在內的醫學和科研服務,覆蓋范圍廣泛。
在2019年5月,多家媒體報道稱安諾優達裁去腫瘤業務。經動脈網求證,目前安諾優達的醫學服務中仍然包含生育和腫瘤業務,其中,生育業務與2017年啟動了NIPT干擾因素研究項目,腫瘤業務方向則轉向了免疫治療。
站高望遠,未來啟示
站高望遠,大公司的視野必定看的更遠,有對市場更長遠的見解。從大公司近幾年的布局中可以預見到NGS領域未來的劇本。
在幾家公司近年的發展足跡中,我們不難發現各家公司都對腫瘤業務相當關注。自燃石醫學取得NGS第一證之后,諾禾致源、世和基因、艾德生物也陸續拿到相應資質,這意味著NIPT之后,腫瘤檢測開始逐步落地。
而另一面,目前國內NGS上游領域仍然主要依靠進口產品,作為IVD產業的重要組成部分,NGS領域的進口替代勢必也會在未來某一天到來。大國重器,如此龐大的NGS市場一定給國產品牌留有一席之地。
在技術應用上,從NIPT到腫瘤,寥寥幾字背后其實是技術、臨床,以及監管多個方向的突破,這也預示著高通量測序在臨床、健康領域應用的更多可能。
就腫瘤來說,除了目前已經由產品獲批的靶向用藥檢測,腫瘤免疫檢測也開展得如火如荼,腫瘤用藥檢測、早篩早診亦有龐大的市場有待挖掘。在遺傳健康領域,NIPT檢測也只是產品化的開拓,除此以外還有罕見病、單基因多基因遺傳病等選擇。其他方面,病原體診斷、單細胞測序正在悄悄崛起。
大的公司在深耕自身業務的同時,也要不斷尋找新的方向,這樣才能夠及時跟上時代的腳步。而行業的發展勢必也會誕生新的格局,新的企業出現,新老企業的交替與爭鋒。腫瘤免疫,儀器試劑,還有我們尚未挖掘的新方向,都將會有新的故事上演。

文 | 周夢亞
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