【洞察】RNA探針細分產品各有優缺點 我國相關研究不斷深入
RNA探針采用示蹤物進行標記,通常采用放射性同位素、地高辛、生物素、熒光染料等,這些示蹤物具有自顯影或者發光效果,以達到高靈敏檢測效果。
RNA探針,是生物探針的一種,屬于核酸探針,是能與相對應核酸序列進行互補結合的一段核酸分子,根據來源來看,主要包括單鏈cDNA探針、cRNA探針、寡核苷酸探針三種。
RNA探針的核酸分子為單鏈,需經過示蹤物標記,然后與靶核酸序列進行雜交,形成雙鏈,對標記物進行探測,可獲得樣品中是否含有目標核酸序列,以及含量的多少與位置。RNA探針核酸分子的選擇需要關注核酸分子的特異性、制備與標記難易程度、雜交穩定性等,早期采用的RNA探針主要是細胞mRNA探針、病毒RNA探針,標記難度較大,應用受到限制。
根據新思界產業研究中心發布的《2024-2028年RNA探針行業深度市場調研及投資策略建議報告》顯示,目前常見的RNA探針細分產品中,單鏈cDNA探針,對相應基因進行轉錄,獲得mRNA,再經逆轉錄獲得cDNA,制備過程較為復雜;cRNA探針,以cDNA為模板,經過體外轉錄獲得cRNA,制備難度較大;寡核苷酸探針,體外人工合成的與目標基因序列互補的單鏈核苷酸片段,對片段長度范圍要求較高,標記物攜帶有限。這些不同類型的RNA探針產品各有優缺點。
RNA探針采用示蹤物進行標記,通常采用放射性同位素、地高辛、生物素、熒光染料等,這些示蹤物具有自顯影或者發光效果,以達到高靈敏檢測效果。例如以地高辛標記的RNA探針為例,可以利用瓊脂糖凝膠電泳檢測片段長度,利用斑點雜交實驗驗證探針靈敏度,雜交完成后標記物檢測方便。
與DNA探針相比,RNA探針具有可改良雜交印跡、雜交反應效率高的優點,但僅能夠在體外轉錄過程中進行標記,且不穩定容易被降解。因此RNA探針一般不應用在檢測領域,主要應用于科研領域。RNA探針可以廣泛應用在動物、植物、微生物、病毒等基因編輯研究領域,例如HIV病毒基因組DNA克隆研究方面。
新思界行業分析人士表示,在全球范圍內,RNA探針提供商主要有瑞士Roche、荷蘭Biolegio、英國Bioline、美國Sigma-Aldrich、美國Empire Genomics、美國Bio-Techne、美國Promega、中國臺灣Abnova Corporation等,主要集中在美國地區,其次是歐洲地區。
我國科研實力不斷進步,RNA探針作為重要工具,研究還在不斷深入。2024年3月,中國科學院大連化學物理研究所研究團隊,發展了能夠與RNA特異性可逆結合,在活細胞內對細胞核核仁穩定成像的“緩沖熒光探針”Nu-AN,實現了對核仁動態輪廓的成像。
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